Préchauffez le four à 180 °C (350 °F) et placez les caissettes en papier dans le moule à muffins.

Dans un grand bol, mélangez la farine, le sucre, la levure et le sel. Remuez avec un fouet pour aérer le mélange.

Dans un autre bol, battez légèrement les œufs, puis ajoutez le lait, le beurre fondu, l'extrait de vanille, le zeste et le jus de citron. Mélangez jusqu'à homogénéité.

Versez le mélange humide sur les ingrédients secs et remuez délicatement jusqu'à ce que la farine soit juste incorporée.

Préparez la garniture au fromage à la crème dans un bol moyen en fouettant le fromage à la crème, le sucre glace et la vanille jusqu'à obtenir une texture lisse.

Remplissez les caissettes à muffins aux 2/3 avec la pâte, déposez une cuillère à café de garniture au centre de chaque muffin et recouvrez légèrement avec un peu de pâte.

Enfournez pour 20 à 25 minutes, ou jusqu'à ce qu'un cure-dent ressorte propre.

Laissez tiédir 5 minutes dans le moule, puis transférez sur une grille pour refroidir complètement.